セミナー

iTHEMS生物学セミナー

The origin and dispersal of buckwheat

2021年6月10日10:00 - 11:00

ジェフリ・フォーセット (数理創造プログラム 上級研究員)

Buckwheat, which soba noodles is made from, originated from a wild species that is distributed in southwest China, around Yunnan, Sichuan, and Tibet. We are trying to understand when, where, and how i...続きを読む

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セミナー

iTHEMS生物学セミナー

An overview of genome-wide epistasis and co-selection analysis

2021年6月3日10:00 - 11:00

インイン・キョ (数理創造プログラム 基礎科学特別研究員)

This talk is a summary of research that have done by me and my team during 2016~2019. I was a postdoc researcher in Aalto university/Helsinki university in Finland. In the team, a worldwide active col...続きを読む

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セミナー

iTHEMS生物学セミナー

A Mathematical Model for Stem Cell Competition to Maintain a Cell Pool Injured by Radiation Exposure

2021年5月27日10:00 - 11:00

内之宮 光紀 (電力中央研究所)

Cancer risk of low-dose-rate ionizing radiation exposure is one of the most important issues in radiation protection. Tissue stem cells have been considered one of the targets of radiation-induced car...続きを読む

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セミナー

Quantum Matter セミナー

Theory of Anomalous Floquet Higher-Order Topology

2021年5月26日22:00 - 23:15

Rui-Xing Zhang (University of Maryland, College Park, USA)

Periodically-driven or Floquet systems can realize anomalous topological phenomena that do not exist in any equilibrium states of matter, whose classification and characterization require new theoreti...続きを読む

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セミナー

iTHEMS数学セミナー

Loewner's theorem for maps on operator domains / The structure of maps on the space of all quantum pure states that preserve a fixed quantum angle

2021年5月24日16:00 - 18:10

森 迪也 (数理創造プログラム 基礎科学特別研究員)

This talk is divided into two independent topics. In the first part of my talk we consider the order structure of hermitian matrices. Given two matrix domains (open connected sets of n-by-n hermitia...続きを読む

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セミナー

iTHEMS生物学セミナー

Organ-to-organ two-way coupling contributes to the stabilization of circadian clock in Arabidopsis.

2021年5月20日10:00 - 11:00

上本 恭平 (京都大学 / 奈良先端科学技術大学院大学)

Circadian clocks increase plant fitness by anticipating periodic environmental changes using unstable temporal information perceived in each tissue/organ. However, little is known about how such local...続きを読む

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セミナー

情報理論SGセミナー

Journal Club: Intrinsically Disordered Region (IDR)

2021年5月19日13:00 - 14:00

足立 景亮 (数理創造プログラム 基礎科学特別研究員 / 理化学研究所 生命機能科学研究センター 生体非平衡物理学理研白眉研究チーム 基礎科学特別研究員)

A class of protein domain, which is called intrinsically disordered region (IDR), is known to take no rigid three dimensional structure. Recent studies have shown that IDRs can show biological functio...続きを読む

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セミナー

iTHEMS数学セミナー

Geometry of canonical metrics on Kähler manifolds

2021年5月14日16:00 - 18:10

井上 瑛二 (数理創造プログラム 基礎科学特別研究員)

The aim of this talk is to report recent trends in Kähler geometry. Kähler geometry consists of two aspects: the one is algebraic geometry and the other is metric geometry.The first one hour is an int...続きを読む

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セミナー

iTHEMS生物学セミナー

Modeling Membrane Morphological Change during Autophagosome Formation

2021年5月14日10:00 - 11:00

境 祐二 (数理創造プログラム 客員研究員(学術機関) / 東京大学大学院 医学系研究科 助教)

Membrane-bound organelles compartmentalize eukaryotic cells and adopt various characteristic shapes such as disk-shaped, tubules, spherical vesicles, and their intermediate structures. Organellar morp...続きを読む

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セミナー

Quantum Matter セミナー

Aperiodic and amorphous topological phases

2021年5月12日17:00 - 18:15

クリストファー・ボーン (数理創造プログラム 客員研究員(学術機関) / 東北大学 材料科学高等研究所 助教)

Key features of topological insulators and superconductors such as stable edge modes have been found in an increasingly broad class of materials and systems. In this talk, I will introduce a mathemati...続きを読む

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セミナー

Dark Matter WGセミナー

Emulation for lensing and clustering observables of the cosmological large-scale structure

2021年5月12日10:00 - 11:00

西道 啓博 (京都大学 基礎物理学研究所)

Recent developments in observational technologies open exciting opportunities to map out the detailed structure of the universe. Remarkably, the unique combination of imaging and spectroscopic galaxy ...続きを読む

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セミナー

iTHEMS生物学セミナー

Kullback-Leibler divergence and stochastic dynamics

2021年5月6日10:00 - 11:00

入谷 亮介 (数理創造プログラム 研究員)

*Detailed information about the seminar refer to the email.

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セミナー

情報理論SGセミナー

Thermodynamic Uncertainty Relation Connects Physics, Information Science, and Biology

2021年4月28日13:30 - 16:00

長谷川 禎彦 (東京大学大学院 情報理工学系研究科 准教授)

Higher precision demands more resources. Although this fact is widely accepted, it has only recently been theoretically proved. The thermodynamic uncertainty relation serves as a theoretical basis for...続きを読む

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コロキウム

MACSコロキウム iTHEMS協賛

第15回MACSコロキウム・2021年度MACS学生説明会

2021年4月23日15:00 - 17:30

石川 博 (早稲田大学 理工学術院 基幹理工学部 情報理工学科 教授)

プログラム 15:00〜16:00 第15回MACSコロキウム「機械に認識させるとはどういうことか」石川 博 博士 16:05~17:30 2021年度MACS学生説明会

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セミナー

iTHEMS数学セミナー

Alternative tsunami observing and forecasting systems

2021年4月22日16:00 - 18:10

イヤン・ムリア (理化学研究所 三好予測科学研究室 研究員)

Dedicated tsunami observing systems are mostly expensive and are often not sustainable. Therefore, alternative approaches should be implemented to overcome the issues. We introduced innovative ways to...続きを読む

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セミナー

iTHEMS生物学セミナー

The rheotaxis mechanism of swimming ciliates

2021年4月22日10:00 - 11:00

西上 幸範 (北海道大学 電子科学研究所)

The swimming unicellular organisms, which live in freshwater, need to resist currents in the environment. Without this ability, their habitat changes with the flow, and they cannot survive in nature f...続きを読む

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セミナー

Quantum Matter セミナー

Unconventional Spin Transport in Quantum Materials

2021年4月21日17:00 - 18:15

Se Kwon Kim (KAIST, Republic of Korea)

Recent advancements in spintronic techniques originally developed for spin-based devices now enable us to study fundamental spin physics of various quantum materials with unprecedented spin-current co...続きを読む

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特別講演会

iTHEMS × academist オンライン一般公開「数理で読み解く科学の世界 2021」

2021年4月18日10:00 - 16:30

後藤 郁夏人 (数理創造プログラム 基礎科学特別研究員)
ジェフリ・フォーセット (数理創造プログラム 上級研究員)
杉浦 拓也 (数理創造プログラム 特別研究員)
辻 直美 (数理創造プログラム 特別研究員)
三上 渓太 (数理創造プログラム 研究員)
初田 哲男 (数理創造プログラム プログラムディレクター)

iTHEMSでは「数学」を共通言語として、物理、生物、宇宙などさまざまな科学分野の横断的な研究をしています。「数理で読み解く科学の世界 2021」では、Web会議サービス「Zoom」を利用し、iTHEMS所属の若手研究者5名がそれぞれ一般の方々を対象に、最先端の研究に関する30分の講演をオンラインで行います。また、一般参加者からの質問やコメントを受け付ける時間も設けています。 なお、本イベン...続きを読む

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コロキウム

iTHEMSコロキウム

Mirror symmetry and KAM theory

2021年4月16日13:30 - 15:00

深谷 賢治 (Permanent Member, Simons Center for Geometry and Physics, Stony Brook University, New York, USA)

13:30pm-15:00pm (JST) Mirror symmetry is a phenomenon discovered in String theory and is much discussed recently in mathematics especially in the field of complex (algebraic) geometry and symplecti...続きを読む

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セミナー

iTHEMS生物学セミナー

Liquid condensates in cell nucleus

2021年4月15日10:00 - 11:00

足立 景亮 (数理創造プログラム 基礎科学特別研究員 / 理化学研究所 生命機能科学研究センター 生体非平衡物理学理研白眉研究チーム 基礎科学特別研究員)

I will give a talk in a journal club style. I will introduce recent papers regarding liquid-liquid phase separation in cells. In cell biology, several types of liquid condensates of proteins/RNAs h...続きを読む

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セミナー

Quantum Matter セミナー

What "Holography" is and how to use it

2021年4月14日17:00 - 18:15

Mario Flory (Instituto de Fisica Teorica, Universidad Autonoma de Madrid, Spain)

In this talk, I will give an introduction to the holographic principle and the Anti-de Sitter/Conformal Field Theory (AdS/CFT) correspondence. I will also discuss the role that quantum entanglement pl...続きを読む

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セミナー

情報理論SGセミナー

Journal Club: Trace inequalities and their applications

2021年4月14日14:30 - 15:30

後藤 ゆきみ (数理創造プログラム 基礎科学特別研究員)

In this talk, I will explain trace inequalities and related topics. Mainly, I focus on results concerning quantum entropy. This talk is an elementary introduction to that subjects. *Detailed inform...続きを読む

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セミナー

Math-Phys ジョイント セミナー

Self-adjoint extension in quantum mechanics and non-Rydberg spectra of one-dimensional hydrogen atom

2021年4月13日16:00 - 18:10

全 卓樹 (高知工科大学 環境理工学群 教授)

We offer a beginner’s guide to the functional-analytical techniques in quantum mechanics, and cover its application to the 1D Coulomb problem. It is shown that the wave function at the diverging poin...続きを読む

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セミナー

iTHEMS生物学セミナー

Simple models of cancer growth, MCMC parameter estimation and identifiability

2021年4月8日10:00 - 11:00

カトゥリン・ボシュメン (数理創造プログラム 副プログラムディレクター / Professor, Department of Physics, Ryerson University, Canada)

I would like to introduce some basic concepts about (very simple) mathematical model of cancer growth, the basic math behind parameter estimation via Markov chain Monte Carlo (MCMC) based on Bayes' th...続きを読む

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セミナー

iTHEMS数学セミナー

Long-time behavior of moving solids in a fluid and the kinetic theory of gases

2021年4月7日16:00 - 18:10

小池 開 (京都大学 工学研究科 特別研究員)

Understanding dynamics of solids in a fluid is a fundamental problem in fluid dynamics. Due to the growing interest in engineering in out-of-equilibrium situations, moving boundary problems for kineti...続きを読む

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セミナー

iTHEMS生物学セミナー

Structural reduction of chemical reaction networks based on topology

2021年4月1日10:00 - 11:00

広野 雄士 (Assistant Professor, Asia Pacific Center for Theoretical Physics, Republic of Korea)

Chemical reactions form a complex network in living cells and they play vital roles for physiological functions. An amusing question is how the structure of a reaction network is linked to its chemica...続きを読む

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コンファレンス

巌佐庸教授退職記念シンポジウム

2021年3月26日16:30 - 17:30

巌佐 庸 (数理創造プログラム 特別顧問 / 関西学院大学 教授)

プログラム ​16:30~17:30​​​ 「生物と数理モデル --- 神戸三田キャンパスでの楽しい日々の報告」 巌佐庸・関西学院大学 理工学部 生命科学科

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セミナー

iTHEMS生物学セミナー

Evolutionary conservativeness and diversification of cycads: Understanding the evolution of living fossils

2021年3月25日10:00 - 11:00

Jose Said Gutiérrez-Ortega (Assistant Professor, Institute for Excellence in Educational Innovation, Chiba University)

The cycads are a lineage of gymnosperms that represent an example of biological stasis success. Despite their early origin in the seed plant evolution, they survived multiple events of mass extinction...続きを読む

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セミナー

情報理論SGセミナー

Journal Club: Reinforcement Learning

2021年3月24日13:00 - 14:00

田中 章詞 (数理創造プログラム 上級研究員)

Reinforcement Learning (RL) is a scheme of Machine Learning that is applicable "without training data." Instead, we prepare a "world" that agents (learners) can probe, and try to optimize their behavi...続きを読む

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セミナー

iTHEMS数学セミナー

The Green-Tao theorem for number fields

2021年3月22日16:00 - 18:10

甲斐 亘 (東北大学 理学部数学科 助教)

5, 11, 17, 23, 29 are prime numbers which form an arithmetic progression of length 5. A famous theorem of Ben Green and Terence Tao in 2008 says there are arbitrarily long arithmetic progressions of p...続きを読む

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セミナー

Quantum Matter セミナー

Geometric nonlinear optical effects

2021年3月16日17:00 - 18:15

森本 高裕 (東京大学 大学院工学系研究科 物理工学専攻 准教授)

Time: 5pm ~ 6:15pm (JST); 9am ~ 10:15am (CET) The responses of materials to high intensity light, i.e., nonlinear optical responses, constitute a vast field of physics and engineering. While geomet...続きを読む

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コンファレンス

iTHEMS NOW & NEXT FY2020

2021年3月11日9:30 - 14:30

We will hold the annual in-house gathering “iTHEMS NOW & NEXT” for this fiscal year as follows. Please join the event and see the activities in iTHEMS and its future. Program: 9:30-10:00 Keynote ...続きを読む

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セミナー

iTHEMS生物学セミナー

Microeconomics of metabolism

2021年3月10日10:00 - 11:00

山岸 純平 (東京大学 金子研究室)

Metabolic behaviors of proliferating cells are often explained as a rational choice to optimize cellular growth rate. In contrast, microeconomics formulates consumption behaviors as optimization probl...続きを読む

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セミナー

Quantum Matter セミナー

Exceptional Topology of Non-Hermitian Systems: from Theoretical Foundations to Novel Quantum Sensors

2021年3月3日17:00 - 18:15

Jan Budich (Professor, Quantum Many-Body Physics, TU Dresden, Germany)

CET: 9:00a.m. - 10:15a.m. on March 3, 2021 JST: 5:00p.m. - 6:15p.m. on March 3, 2021 EST: 3:00a.m. - 4:15a.m. on March 3, 2021 In a broad variety of physical scenarios ranging from classical meta...続きを読む

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コンファレンス

iTHEMS共催

The 8th Asia-Pacific Conference on Few-Body Problems in Physics (APFB2020)

2021年3月1日 - 5日

The next Asia-Pacific conference on few-body problems in physics (APFB2020) will be held at KANAZAWA BUNKA HALL, Kanazawa, Japan, from 1 to 5 March 2021. RIKEN iTHEMS is a co-host of this conference ...続きを読む

会場: 金沢市文化ホール

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セミナー

iTHEMS生物学セミナー

Origin of non-linearity of large deformation on DNA stretched

2021年2月25日10:00 - 11:00

横田 宏 (数理創造プログラム 特別研究員)

Since DNA in a cell is mechanically stretched or rotated by many proteins, the mechanical response of DNA in vitro is expected to be basic point for understanding its behavior. When DNA is stretched b...続きを読む

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セミナー

ABBL-iTHEMS ジョイントセミナー

The Evolution of Primordial Neutrino Helicities under Gravitational and Magnetic Fields and Implications for their Detection

2021年2月22日10:00 - 11:30

ゴードン・ベイム (数理創造プログラム 客員主管研究員 / Professor Emeritus, University of Illinois, USA)

Feb.22 (Mon) 10:00am-11:30am (JST) Primordial neutrinos decoupled in the early universe in helicity eigenstates. As I will discuss, two effects -- dependent on neutrinos having a non-zero mass -- ...続きを読む

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セミナー

iTHEMS生物学セミナー

High-throughput laboratory evolution with machine learning reveals constraints for drug resistance evolution

2021年2月18日10:00 - 11:00

岩澤 諄一郎 (東京大学 理学系研究科物理学専攻 博士課程)

The understanding of evolution is crucial to tackle the problem of antibiotic resistance which is a growing health concern. Although the lack of sufficient data has long hindered the mechanism of evol...続きを読む

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コロキウム

MACSコロキウム iTHEMS協賛 SUURI-COOL (Kyoto)

第14回 MACSコロキウム

2021年2月17日15:00 - 17:30

金子 善宏 (京都大学理学研究科 地球惑星科学専攻 地球物理学教室 准教授)

プログラム 15:00〜16:00 「数値シミュレーションで地震現象の謎に迫る」 金子 善宏 博士(京都大学理学研究科 地球惑星科学専攻 地球物理学教室 准教授) 16:05〜16:30 各スタディグループのフラッシュトーク 16:30〜17:30 各スタディグループの意見交換(Zoomブレイクアウトルーム)

会場: via Online

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セミナー

情報理論SGセミナー

Journal Club: Large deviation statistics of Markovian quantum systems

2021年2月17日13:00 - 14:30

濱崎 立資 (数理創造プログラム 上級研究員 / 理化学研究所 開拓研究本部 濱崎非平衡量子統計力学理研白眉研究チーム 理研白眉研究チームリーダー)

Large deviation is a mathematical framework to treat “rare events” in random processes [1]. In this journal club, I talk about recent development of large deviation analysis in open Markovian quantum ...続きを読む

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コンファレンス

iTHEMS共催

Blockchain in Kyoto 2021

2021年2月17日 - 18日

Language: Some parts will be in Japanese. The International Conference on Blockchains and their Applications aims at bringing together researchers and practitioners from various communities of scie...続きを読む

会場: partly online

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講演会・レクチャー

Public Lecture for Darwin Day

2021年2月17日9:00 - 10:00

カトゥリン・ボシュメン (数理創造プログラム 副プログラムディレクター / Professor, Department of Physics, Ryerson University, Canada)

Japan, February 17, 2021, 09:00 AM JST Canada/USA, Feb 16, 2021, 07:00 PM Eastern Time Through mutations and genetic reassortment, a virus can mutate and the resulting virus variants can evade our...続きを読む

会場: via Zoom

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セミナー

Dark Matter WGセミナー

Mapping the Milky Way by VLBI Astrometry

2021年2月16日13:30 - 15:00

坂井 伸行 (Korea Astronomy and Space Science Institute (KASI))

Astrometry is the only way to obtain 6D (position-velocity) phase space information for astronomical objects. The unique capability allows us to examine the past, present, and future of the Milky Way....続きを読む

会場: via Zoom

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セミナー

理論物理学セミナー

Quantum mechanical description of energy dissipation and application to heavy-ion fusion reactions

2021年2月16日13:00 - 14:30

時枝 正明 (東北大学 大学院理学研究科物理学専攻 大学院生)

For theoretical description of heavy-ion fusion reactions, two different models have been used depending on the incident energy. At energies above the Coulomb barrier, importance of energy dissipation...続きを読む

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セミナー

iTHEMS生物学セミナー

A machine learning approach for prediction of mitochondrial proteins in non-model organisms

2021年2月12日10:00 - 11:00

久米 慶太郎 (筑波大学 医学医療系 助教)

The evolution of the repertoire of proteins localized to organelles is important for understanding the evolutionary process of organelles. However, experimental methods for identifying organelle-local...続きを読む

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ワークショップ

iTHEMS共催

第12回 理研・京大データ同化研究会

2021年2月10日13:30 - 16:30

言語:日本語・英語 参加締め切り: 2021年2月9日(火) データ同化は、近年応用数学分野で発展が著しい不確実性定量化(Uncertainty Quantification: UQ)と関係が深く、 数理モデル(数理科学)、シミュレーション(計算科学)と現実世界のデータ(データ科学)が結びついた学際的科学である。 その理論的背景には力学系理論・確率論・微分方程式論・数値解析およびデータサイ...続きを読む

会場: オンライン開催

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セミナー

理論物理学セミナー

Quantum kinetic theory for chiral and spin transport in relativistic heavy ion collisions and core-collapse supernovae

2021年2月4日13:00 - 14:30

Di-Lun Yang (慶應義塾大学 理工学部 助教)

Recently, the anomalous transport phenomena of relativistic fermions associated with chirality and spin induced by external fields have been greatly explored in different areas of physics. Notably, su...続きを読む

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セミナー

iTHEMS生物学セミナー

System identification of mechano-chemical epithelial sheet dynamics

2021年2月4日10:00 - 11:00

浅倉 祥文 (京都大学 生命科学研究科 理論生物学分野 博士後期課程三年)

Collective migration of epithelial cells is a fundamental process of multi-cellular organisms. Our recent study using live imaging with FRET-based biosensor discovered that cell migration within an ep...続きを読む

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セミナー

Quantum Matter セミナー

Mathematics of magic angles for bilayer graphene

2021年2月3日20:00 - 21:15

Simon Becker (PhD Student Department of Applied Mathematics and Theoretical Physics University of Cambridge)

20:00pm ~ 21:15pm on Feb. 03th, 2021 (JST) 11:00am ~ 12:15am on Feb. 03th, 2021 (UK) Magic angles are a hot topic in condensed matter physics: when two sheets of graphene are twisted by those angl...続きを読む

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セミナー

理論物理学セミナー

Many body problems from quarks to stellar evolutions

2021年1月28日13:30 - 15:00

安武 伸俊 (千葉工業大学 情報科学部 教育センター 准教授)

The many-body problems are major problems that need to be clarified not only in nuclear physics, but also in astronomy. In this seminar, I introduce stellar evolutions as gravitational many-body probl...続きを読む

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セミナー

iTHEMS生物学セミナー

Numerical inference of the molecular origin of the cyanobacterial circadian rhythm

2021年1月28日10:00 - 11:00

甲田 信一 (分子科学研究所 計算分子科学研究領域 助教)

The cyanobacterial clock proteins, KaiA, KaiB, and KaiC, are known as the simplest biological clock; Just by mixing them with ATP in a test tube, self-sustaining oscillation with a nearly 24h temperat...続きを読む

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セミナー

情報理論SGセミナー

Journal Club: Sampling the stable structures based on replica-permutation method

2021年1月27日13:00 - 14:30

横田 宏 (数理創造プログラム 特別研究員)

When we want to search the (meta)stable structures of the macromolecules such as protein, the combination of molecular dynamics simulation and replica exchange method (REM) is useful. In REM, sampling...続きを読む

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セミナー

iTHEMS生物学セミナー

Introduction to Boolean modeling and Boolean networks as information processing units

2021年1月21日10:00 - 11:00

岡田 崇 (数理創造プログラム 上級研究員)

Boolean networks are widely used in physics, biology, social science, and computer science. In this talk, I will introduce the basics of Boolean networks and give an overview of Biological application...続きを読む

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セミナー

情報理論SGセミナー

Information theory in ecology: Markov chain, Venn diagram, Kronecker (and Cartesian graph) products, and Tsallis entropy

2021年1月20日13:00 - 14:00

入谷 亮介 (数理創造プログラム 研究員)

This is more like an introductory talk on how I was motivated to work with information theory, and include unpublished data. Ecologists have been long interested in understanding diversity (diverge...続きを読む

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セミナー

Quantum Matter セミナー

Time-dependent driven quantum critical systems in (1+1) dimension

2021年1月18日10:00 - 11:15

Xueda Wen (Postdocs, Physics Department, Harvard University, USA)

10:00am ~ 11:15am on Jan. 18th, 2021 (JST) 8:00pm ~ 9:15pm on Jan. 17th, 2021 (EST) I will introduce an analytically solvable setup for time-dependent driven quantum critical systems in (1+1)D, wh...続きを読む

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セミナー

iTHEMS生物学セミナー

What are genes and how can we find them?

2021年1月14日10:00 - 11:00

ジェフリ・フォーセット (数理創造プログラム 上級研究員)

Although 'gene' is a word that is used frequently in the society, most people probably do not know what genes actually are. In fact, its definition is not so straightforward. In this talk, I will firs...続きを読む

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セミナー

情報理論SGセミナー

Accelerated equilibration in classical stochastic systems

2021年1月13日13:00 - 14:00

足立 景亮 (数理創造プログラム 基礎科学特別研究員 / 理化学研究所 生命機能科学研究センター 生体非平衡物理学理研白眉研究チーム 基礎科学特別研究員)

Shortcuts to adiabaticity (STA) [1] are processes that make a given quantum state evolve into a target state in a fast manner, which can be useful to avoid decoherence in quantum experiments. In this ...続きを読む

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セミナー

iTHEMS生物学セミナー

From local resynchronization to global pattern recovery in the zebrafish segmentation clock

2021年1月7日10:00 - 11:00

瓜生 耕一郎 (金沢大学 生命理工学類 助教)

Tissue-scale developmental patterns are often generated by local cellular interactions and global tissue deformation. An example is gene expression rhythms in vertebrate, termed the segmentation clock...続きを読む

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