コロキウム

Systems Biology of Cellular Rhythms

2018年7月2日(月) 15:00 - 16:30

Prof. Albert Goldbeter (Professor, Unit of Theoretical Chronobiology, Faculty of Sciences, Université Libre de Bruxelles, Belgium)

Rhythmic phenomena occur at all levels of biological organization, with periods ranging from milliseconds to years. Among biological rhythms, circadian clocks, of a period close to 24h, play a key role as they allow the adaptation of living organisms to the alternation of day and night. Biological rhythms represent a phenomenon of temporal self-organization in the form of sustained oscillations of the limit cycle type. Mathematical models show how the emergent property of oscillatory behavior arises from molecular interactions in cellular regulatory networks, which explains why cellular rhythms represent a major research topic in systems biology. After providing an introduction to biological rhythms and their modeling, I will focus on mathematical models for two major examples of rhythmic behavior at the cellular level : the circadian clock and the cell cycle. The coupling of these rhythms allows for their synchronization and for the occurrence of more complex patterns of oscillatory behavior. I will discuss the reasons why models for cellular rhythms tend to become more complex, upon incorporating new experimental observations. The case of cellular rhythms allows us to compare the merits of simple versus complex models for the dynamics of biological systems.

会場: 鈴木梅太郎記念ホール

配信:計算科学研究棟 305-2会議室 / SUURI-COOL (Kyoto) / 東北大学 AIMR本館 2階セミナー室

イベント公式言語: 英語

On the interplay between intrinsic and extrinsic instabilities of spatially localized patterns

2018年6月7日(木) 15:00 - 16:30

西浦 廉政 (東北大学 材料科学高等研究所 (AIMR) 教授)

Spatially localized dissipative structures are observed in various fields, such as neural signaling, chemical reactions, discharge patterns, granular materials, vegetated landscapes, binary convection and block copolymer nanoparticles. These patterns are much simpler than single living cells, however they seem to inherit several characteristic “living state” features, such as generation of new patterns, self-replication, switching to new dynamics via collisions and adaptive morphological changes to environments. These behaviors stem from an interplay between the intrinsic instability of each localized pattern and the strength of external signals. To understand such an interplay, we explore the global geometric interrelation amongst all relevant solution branches of a corresponding system with approximate unfolding parameters. For instance, it has been uncovered that large deformation via strong collision is mapped into the network of unstable patterns in infinite dimensional space, and that an organizing center for 1D pulse generators is a double homoclinicity of butterfly type. Large deformation of patterns is unavoidable so that a global geometric structure formed by all relevant solution branches gives us much more insight rather than conventional PDE approaches. We illustrate the impact of this approach for the case of pulse generators. We also report on the recent exciting finding, namely the formation of exotic 3D nanoparticles of block copolymers caused by the interplay between internal repulsion and affinity to external solvent, which is consistent with experimental results.

会場: 仁科ホール

配信:計算科学研究棟 305-2会議室 / SUURI-COOL (Kyoto)

イベント公式言語: 英語

第4回 MACSコロキウム・平成30年度MACS学生説明会

2018年4月27日(金) 15:00 - 16:45

立川 裕二 (東京大学 カブリ数物連携宇宙研究機構 (Kavli IPMU) 教授)

15:00- ティータイム 15:15- 立川 裕二 博士「ある場の量子論屋の見た数学」 16:45- 平成30年度MACS学生説明会 第4回MACSコロキウム（iTHEMS協賛）です。理研和光へのSkype配信がありますが、可能な方は是非京都で参加してください。おいしいケーキとクッキーもありますよ。

会場: 京都大学 理学部 6号館 401講義室

配信:研究本館 433号室

イベント公式言語: 日本語

The Description of Biological Phenomena as Open System / Every Biological Variable has a Different Dynamic Range

2018年4月23日(月) 15:00 - 16:30

桜田 一洋 (理化学研究所 科技ハブ産連本部 (RCSTI) 医科学イノベーションハブ推進プログラム 副プログラムディレクター)
清田 純 (理化学研究所 科技ハブ産連本部 (RCSTI) 健康医療データAI解析標準化ユニット ユニットリーダー)

The Description of Biological Phenomena as Open System / Dr. Sakurada Every Biological Variable has a Different Dynamic Range / Dr. Seita

会場: 大河内記念ホール

配信:計算科学研究棟 6階 講堂 / SUURI-COOL (Kyoto) / SUURI-COOL (Sendai)

イベント公式言語: 英語

Approaches to inflationary cosmology

2017年12月19日(火) 15:00 - 16:30

横山 順一 (東京大学)

第24回iTHES理論科学コロキウム

会場: 大河内記念ホール

イベント公式言語: 英語

Simulations and machine learning going hand in hand for clinical medicine

2017年10月30日(月) 15:00 - 16:30

水藤 寛 (東北大学 材料科学高等研究所 (AIMR) 教授)

第23回iTHES理論科学コロキウム

会場: 理化学研究所 和光キャンパス RIBF棟 2階 大会議室

配信:計算科学研究棟 R511

イベント公式言語: 英語

Introduction to topological quantum computing

2017年7月28日(金) 15:00 - 16:30

Prof. Zhenghan Wang (University of California Santa Barbara, USA)

第22回iTHES理論科学コロキウム

会場: 鈴木梅太郎記念ホール

イベント公式言語: 英語

Shapes of discrete groups

2017年5月18日(木) 15:30 - 17:00

坪井 俊 (数理創造プログラム 副プログラムディレクター)

第21回iTHES理論科学コロキウム

会場: 鈴木梅太郎記念ホール

イベント公式言語: 英語

一般相対性理論と重力波

2017年4月13日(木) 15:00 - 16:30

田中 貴浩 (京都大学 教授)

第20回iTHES理論科学コロキウム

会場: 大河内記念ホール

イベント公式言語: 英語

量子アニーリングによる量子計算

2017年1月27日(金) 15:00 - 16:30

西森 秀稔 (東京工業大学 教授)

第19回iTHES理論科学コロキウム

会場: 大河内記念ホール

イベント公式言語: 英語